在中科院大科學(xué)裝置開(kāi)放研究項(xiàng)目“依托種質(zhì)資源庫(kù)的植物DNA條形碼研究”的支持下,中國(guó)植物條形碼研究團(tuán)隊(duì)在種子植物DNA條形碼研究上取得重要進(jìn)展,有關(guān)成果日前在線發(fā)表于美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院院刊》上。
據(jù)該團(tuán)隊(duì)成員、中科院昆明植物所副研究員高連明介紹,DNA條形碼是利用標(biāo)準(zhǔn)基因片段對(duì)物種進(jìn)行快速和準(zhǔn)確鑒定的新技術(shù)。線粒體細(xì)胞色素C氧化酶基因CO1已成為較理想的動(dòng)物DNA條形碼。但由于植物線粒體基因進(jìn)化速率較慢,篩選有效的植物DNA條形碼已成為“國(guó)際生命條形碼計(jì)劃”的首要研究任務(wù)之一。
為此,從2009年以來(lái),中科院昆明植物研究所研究員李德銖聯(lián)合全國(guó)19個(gè)科研院所和高校,組成了中國(guó)植物條形碼研究團(tuán)隊(duì)。他們對(duì)主要來(lái)自中國(guó)的種子植物75科141屬1757種共約6286個(gè)樣本進(jìn)行綜合分析,發(fā)現(xiàn)三個(gè)質(zhì)體DNA候選條形碼片段具有較高通用性;核糖體核DNA候選條形碼ITS在被子植物中的通用性較高,而在裸子植物中稍低。
同時(shí),他們還發(fā)現(xiàn):ITS具有最高的物種分辨率,與三個(gè)質(zhì)體DNA條形碼片段的任何一個(gè)組合均可分辨69.9%~79.1%的物種。ITS的部分序列ITS2也表現(xiàn)出較高的物種分辨率。
因此,研究團(tuán)隊(duì)建議將ITS作為種子植物的核心DNA條形碼,同時(shí)強(qiáng)調(diào)了利用多個(gè)樣本取樣和不同遺傳方式的DNA片段開(kāi)展植物DNA條形碼研究的重要性。
國(guó)際生命條形碼聯(lián)盟植物工作組主席Pete Hollingsworth認(rèn)為,該論文的發(fā)表,標(biāo)志著在將DNA序列數(shù)據(jù)納入植物物種水平分類和鑒定常規(guī)應(yīng)用方面邁出了重要一步。
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